Загрузка прошивки (*.bin файла) в микроконтроллер SAM3X8E (DUE) без применения IDE Arduino или других.
1) Скачиваем программу BOSSA (bossa-x64-1.9.1.msi илиbossa-x86-1.9.1.msi) c сайта https://github.com/shumatech/BOSSA/releases
2) Устанавливаем программу BOSSA и запускаем.
3) Подключаем микроконтроллер (контроллер) к COM порту "Prog".
4) Нажимаем на секунду кнопку "Erase" на контроллере, затем кнопку "Reset".
5) В программе BOSSA нажимаем кнопку "Refresh":

6) В окошке "Serial Port" выбираем COM порт контроллера.

7) Внизу (в подвале) программы BOSSA слева должна появиться надпись "Connected", справа "Device: ATSAM3X8".

8) В окошке "Browse" указываем путь к нашему bin файлу.
9) Устанавливаем "птички" в окошках "Erase all" и "Boot to flash".

10) Нажимаем на кнопку "Write" и наблюдаем процесс прошивки.

11) При необходимости можете сравнить прошивку "Verify" или посмотреть иную информацию "Info". Все эти операции нужно проводить до нажатия кнопки "Reset" контроллера. Сбрасываем и наслаждаемся новой программой.
Эта процедура может пригодиться при загрузке bin файла с защитой или просто при смене программы, не имея должной подготовки.